根據JR東日本公布的2024年度乘車人數資料，新宿站每日平均乘車人數為666,809人，居該公司各站之首。這只是JR線的數字，實際上這裡是小田急電鐵、京王電鐵、東京地鐵、都營地鐵匯集的巨型轉運站。剪票口數量眾多，初次造訪的人確實容易困惑。不過，只要事先掌握幾個原則，移動本身並不難。本文將依序整理路線、出口的思考方式、轉乘以及投幣置物櫃。
首先要做的是弄清楚自己要搭的路線屬於哪家公司。在新宿站，以下公司的路線在此交會。
這裡需要注意的是東京地鐵副都心線。副都心線不停靠新宿站，而是停靠相鄰的新宿三丁目站（F13）。新宿三丁目站也有丸之內線（M09）和都營新宿線（S-02）經過，與新宿站以地下通道及地面相連，但在指標上是作為另一個車站引導。打算搭副都心線的人，以「新宿三丁目」查詢目的地會更保險。
訪日旅客最容易搞錯的是西武新宿線的「西武新宿站」。西武新宿站並不在JR新宿站站內，而是位於歌舞伎町方向稍遠的地方。根據JR東日本經營的媒體介紹，兩站相距約400公尺，步行約需7～8分鐘。即使轉乘查詢App顯示「新宿站」，要搭西武新宿線也必須先出站步行過去。
從JR新宿站前往時，起點是地下1樓的東剪票口。路線大致有三條。地面路線是出東剪票口後往歌舞伎町方向上到地面，沿鐵路前行的最短路線。下雨天，從東剪票口經地下街新宿Subnade的地下路線很方便，但比地面稍微繞遠。推嬰兒車或坐輪椅的人，可走從東剪票口附近的電梯經LUMINE EST新宿的無障礙路線。所需時間請都視為參考。
新宿站的剪票口名稱和出口編號可能因改良工程而變更。與其死背編號，不如記住哪個方向有什麼更實用。JR東日本的車站介紹中，新宿站的剪票口有南剪票口、西剪票口、中央東剪票口、中央西剪票口、東剪票口、東南剪票口、新南剪票口、甲州街道剪票口、Miraina Tower剪票口、小田急轉乘口。大致對應如下。
實際位置關係，請務必以各公司的官方站內圖確認最新資訊。
JR新宿站是南北狹長的結構，偏北的東剪票口・西剪票口與偏南的南剪票口・新南剪票口，雖然在同一車站內，卻相距甚遠。如果從月台下樓的位置不對，就得走很長的路才能到達目標剪票口。搭車前，哪怕只是留意想去的出口是偏北還是偏南，也會大不相同。
東西方向移動時值得記住的是東西自由通道。根據新宿區的資料，這條通道於2020年7月19日開通，長約100公尺，寬約25公尺。不必通過剪票口就能往返車站東西兩側，因此對沒有車票的人，或弄錯東口和西口時重新調整方向都很有幫助。
另外，根據京王電鐵的介紹，隨著東西自由通道開通，從京王線連絡口經JR站內穿越到中央東剪票口的路線已無法使用。從京王線前往東口方向時，需從京王線的西口等處經東西自由通道前往。
在新宿站轉乘，以下組合比較常見。
轉乘時間請預留充裕。尤其大江戶線和京王新線位於地下深處，上下移動需要時間。
新宿站在剪票口內外各處都設有投幣置物櫃。JR東日本經營的媒體介紹了東口的地下通道和地面、南剪票口附近等地點。費用參考依尺寸約300日圓至1,000日圓左右，旺季可能會加價。
旺季很難找到空櫃，事先確認最為保險。站內部分置物櫃可在專用網站查看空位情況，部分也支援事先預約（預約需另付費用）。此外，還有將寄放的行李當天配送到東京都內飯店的服務，以及配送到指定地址的服務。若大型行李箱放不進去，車站周邊的行李寄放處也是一個選擇。
如果還是迷路了，請依以下順序冷靜應對。
新宿站雖然規模龐大，但各公司的指標都很完善。先弄清路線和公司，出口按「靠近什麼」來記。只要留意這兩點，移動就會輕鬆許多。
※本文資訊為2026年8月時的內容。車站結構、剪票口名稱及出口可能因改良工程等而變更。出發前請確認各鐵路公司的官方站內圖。
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